Pesquisadores mapeiam ciclo de vida do arroz com IA e atlas 3D
Equipe chinesa publica primeiro atlas celular 3D do arroz em Cell, combinando transcriptômica espacial e o modelo de fundação RICE scGPT.
Resumo rápido
- Pesquisadores publicaram um atlas celular tridimensional do ciclo de vida do arroz na revista Cell.
- O projeto combina transcriptômica espacial e sequenciamento de RNA para mapear tecidos e tipos celulares.
- Um portal e o modelo de fundação RICE scGPT foram disponibilizados para pesquisadores globais.
Entenda o contexto
O estudo aborda o mapeamento celular completo de uma planta de importância agrícola utilizando tecnologias de sequenciamento genético e inteligência artificial. A iniciativa busca solucionar dificuldades históricas de melhoramento genético em que a alteração de um traço acaba prejudicando outros.
Uma equipe liderada por pesquisadores chineses publicou na revista Cell um atlas celular tridimensional e espaçotemporal que abrange todo o ciclo de vida do arroz, desde a semente germinada até o florescimento e o preenchimento de grãos. O estudo, intitulado "A spatiotemporal lifecycle atlas decodes spatial coordination in rice", foi lançado online na noite de 6 de outubro de 2026. A instituição correspondente é a Southern University of Science and Technology, contando com o professor titular Hongwei Guo entre os autores correspondentes e colaborações de diversas entidades científicas do país.
Para construir o recurso, a equipe combinou o sequenciamento de RNA de núcleo único com a tecnologia de transcriptômica espacial Stereo-seq da BGI na variedade de arroz japonica Zhonghua 11. O trabalho abrange 10 tipos de órgãos e tecidos distribuídos em 61 estágios de desenvolvimento. Segundo os dados divulgados, os conjuntos cobrem cerca de 851.725 núcleos e 347.640 compartimentos espaciais, definindo 119 tipos celulares e 133 subtipos. Além disso, uma trajetória de desenvolvimento inferida conecta estados celulares desde o embrião inicial até órgãos maduros.
Ferramentas para pesquisadores e melhoramento genético
Com o objetivo de apoiar a comunidade científica, os parceiros do BGI Research desenvolveram o portal Rice Spatio Temporal Atlas para consultas de genes, visualizações de expressão espacial e comparações. Paralelamente, foi lançado o RICE scGPT, um modelo de fundação unicelular adaptado para o arroz que auxilia na anotação de tipos celulares com padrões semelhantes em outros estudos. De acordo com a emissora China Central Television, o recurso deve auxiliar em práticas de melhoramento de precisão por meio do direcionamento a módulos específicos.
Referências
- Fonte consultada: Pandaily — Tecnologia chinesa
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